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    廣葉繡球菌DASH型隱花色素同源基因Slcry1的序列與表達(dá)分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-27  【來源】:食用菌學(xué)報(bào)
    【作者】楊馳 馬璐 肖冬來 應(yīng)正河 江曉凌 林衍銓
    【機(jī)構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所 特色食用菌繁育與栽培國(guó)家地方聯(lián)合工程研究中心
    摘要:用關(guān)鍵詞"DNA photolyase (pfam 00875)"和"FAD binding domain of DNA photolyase (pfam03441)"搜索廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)閩繡1號(hào)菌株基因組,找到一個(gè)候選基因——隱花色素同源基因Slcry1,PCR擴(kuò)增得到該同源基因cDNA全長(zhǎng)1755 bp,基因組全長(zhǎng)為2279 bp;利用PROTPARAM預(yù)測(cè)SlCRY1蛋白含有584個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量為65800,等電點(diǎn)為8.94;利用SMART和Pfam預(yù)測(cè)其保守結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)SlCRY1蛋白(584個(gè)氨基酸)包含一個(gè)DNA光解酶(DNA Photolyase)結(jié)構(gòu)域和一個(gè)FAD結(jié)合(FAD binding)結(jié)構(gòu)域;用MEGA7軟件中的鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)SlCRY1屬于光解酶/隱花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隱花色素;最后用熒光定量PCR檢測(cè)該同源基因在廣葉繡球菌不同發(fā)育階段及光照處理下的表達(dá)量:在約300 lx白色LED光照下,基因Slcry1表達(dá)量隨光照時(shí)間延長(zhǎng)而增加;不同發(fā)育時(shí)期,Slcry1基因的表達(dá)水平為子實(shí)體>原基>菌絲。實(shí)驗(yàn)結(jié)果揭示:SlCRY1屬于DASH型隱花色素,其表達(dá)量受到光照的誘導(dǎo),且隨廣葉繡球菌的生長(zhǎng)發(fā)育而上升。 
    基金:福建省公益類科研院所專項(xiàng)(2016R1019-4); 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)PI項(xiàng)目(2016PI-44); 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(STIT2017-1-6);
    關(guān)鍵詞:廣葉繡球菌; 隱花色素; Slcry1; 食藥用菌;
     
     
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