【作者】張磊 仝宗軍 嚴(yán)俊杰 黃蓉梅 劉媛媛 李冰玉 汪健芳 謝寶貴

【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心

摘要：基于金針菇(Flammulina velutipes)基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),運(yùn)用本地BLAST方法,找到一個(gè)小G蛋白R(shí)an的編碼基因,命名為FvRan1。運(yùn)用生物信息學(xué)方法進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:該基因全長(zhǎng)為1337bp,編碼區(qū)長(zhǎng)度為1079bp,包含7個(gè)外顯子和6個(gè)內(nèi)含子,其中4個(gè)內(nèi)含子(I1、I2、I3、I6)在mRNA加工過(guò)程中存在可變剪切現(xiàn)象。通過(guò)氨基酸序列同源比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),FvRan1具有5個(gè)G-Box保守結(jié)構(gòu)域和2個(gè)效應(yīng)器開(kāi)關(guān),與擔(dān)子菌中Moniliophthora roreri以及Trametes versicolor的親緣關(guān)系最近。采用RT-qPCR研究FvRan1在不同生長(zhǎng)時(shí)期及部位、伸長(zhǎng)期菌柄的不同部位以及豎直、微重力(旋轉(zhuǎn))、水平3個(gè)不同處理?xiàng)l件下的表達(dá)量,結(jié)果表明,FvRan1在成熟期菌柄中的表達(dá)量最高;在金針菇伸長(zhǎng)區(qū)段的表達(dá)量顯著高于生長(zhǎng)點(diǎn)和非伸長(zhǎng)區(qū)段;在模擬微重力條件下,FvRan1呈顯著上調(diào)表達(dá)。FvRan1基因在金針菇菌柄伸長(zhǎng)與重力應(yīng)答過(guò)程中可能具有正調(diào)控作用。 

基金：國(guó)家“973”項(xiàng)目(2014CB138302)；

關(guān)鍵詞：金針菇; Ran蛋白; 菌柄伸長(zhǎng); 重力刺激; 熒光定量PCR;