【作者】王瑩 高英女 汪瀅 李燕 唐利 華白睿 鮑大鵬
【機構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所 上海海洋大學(xué)食品學(xué)院
摘要：利用生物信息學(xué)方法從蛋白質(zhì)基本理化特性、信號肽和亞細(xì)胞定位、分子進(jìn)化與翻譯后修飾位點以及蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)等方面,對南方靈芝(Ganoderma australe)中免疫調(diào)節(jié)蛋白c13717進(jìn)行預(yù)測分析,并將c13717蛋白的分析結(jié)果與三種典型的真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫調(diào)節(jié)蛋白ACA進(jìn)行比較分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),c13717蛋白相對分子質(zhì)量為14150,N端具有信號肽,亞細(xì)胞定位于細(xì)胞外,遺傳進(jìn)化與ACA相近,而與LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo較遠(yuǎn),翻譯后修飾位點較少,蛋白三維結(jié)構(gòu)含有cerato-platanin(CP)結(jié)構(gòu)域,不具有真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白典型的FNIII結(jié)構(gòu),證明c13717蛋白不屬于真菌免疫調(diào)節(jié)蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而屬于CP蛋白家族,可能具有獨特的生物活性。
基金：上海市農(nóng)口青年人才成長計劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-11號]、上海市農(nóng)口青年人才成長計劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-10號]項目資助；
關(guān)鍵詞：南方靈芝; 理論預(yù)測; 結(jié)構(gòu)特征; 免疫調(diào)節(jié)蛋白;