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    基于ITS序列的靈芝遺傳多樣性與群體遺傳分化研究


    【發(fā)布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】劉雪瑩 韓玉立 司靜 李春道 崔寶凱
    【機(jī)構(gòu)】北京林業(yè)大學(xué)微生物研究所臨沂市生產(chǎn)力促進(jìn)中心
    摘要:本研究基于ITS序列對中國8個(gè)不同地理群體的168份靈芝樣本的分子變異、遺傳多樣性、群體遺傳分化程度進(jìn)行了分析。結(jié)果表明:168個(gè)樣品中共檢測到39個(gè)單倍型(H1-H39),表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性水平(Hd=0.867±0.018,Pi=0.00304±0.00024),各群體的遺傳多樣性水平相差不大;TCS單倍型網(wǎng)絡(luò)圖和基于ML、NJ法構(gòu)建的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,各地理群體的遺傳距離與地理距離之間沒有形成對應(yīng)關(guān)系,二者沒有明顯的相關(guān)性;AMOVA分析結(jié)果顯示不同地理群體間的遺傳變異占4.33%,群體內(nèi)的變異占95.67%,遺傳分化主要來自于群體內(nèi)部??傮w和各地理群體的中性檢驗(yàn)結(jié)果顯示,群體擴(kuò)張遵循中性進(jìn)化,群體大小保持相對穩(wěn)定。整體的遺傳分化指數(shù)Fst為0.04331,基因流Nm為2.99,表明各地理群體間存在頻繁的基因交流,群體遺傳分化較小。推測原因可能為種群擴(kuò)張歷史較短,分布范圍較窄,造成遺傳多樣性偏低,各群體間遺傳分化不大。 
     
    基金:國家自然科學(xué)基金(31670016)~~;
     
    關(guān)鍵詞:ITS序列; 分子標(biāo)記; 單倍型; 基因流; 藥用菌;
     
     
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