【作者】楊瑞恒李燕唐利華李傳華鮑大鵬

【機構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點實驗室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所

摘要：傘菌目Agaricales隸屬于擔(dān)子菌門Basidiomycota、傘菌亞門Agaricomycotina,是擔(dān)子菌門中最大的一個類群,能夠以腐生、寄生以及共生的模式在自然環(huán)境中生存,生存范圍廣,對于維持生態(tài)環(huán)境的平衡具有重要的作用。本研究基于51株傘菌目真菌基因組大數(shù)據(jù)挖掘降解木質(zhì)纖維素相關(guān)的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)和氧化還原酶(oxidoreductases),同時比較白腐菌、褐腐菌、腐生菌、菌根菌、植物致病菌、兼性寄生菌、動物共生菌和不明生態(tài)型真菌降解機制的差異。結(jié)果顯示白腐菌和褐腐菌等木腐菌、菌根菌、兼性寄生菌、其他腐生菌、植物致病菌以及共生菌的CAZymes家族平均數(shù)目為134個、93個、101個、127個、61個和32個,而CAZymes同源的基因平均數(shù)目為398個、240個、463個、407個、418個、131個和38個,木腐菌的CAZymes家族最為豐富,但是兼性寄生菌基因數(shù)目最多;同時具有木質(zhì)纖維素降解酶活性的26個家族中,基因數(shù)目分別為86個、32個、101個、86個、104個、36個和10個。在木腐... 更多

 

基金：上海市科技興農(nóng)重點攻關(guān)項目[滬農(nóng)科攻字(2016)第6-1-3號； 滬農(nóng)科攻字(2015)第6-2-1； 滬農(nóng)科攻字(2014)第7-1-6]； 上海市市級農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長計劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-9號]； 國家食用菌工程研究中心(16DZ2281300)~~；

 

關(guān)鍵詞：基因組規(guī)模; 傘菌目; 碳水化合物活性酶; 氧化還原酶;