【作者】吳小梅張昕李南羿

【機構(gòu)】浙江農(nóng)林大學林業(yè)與生物技術(shù)學院浙江農(nóng)林大學農(nóng)業(yè)與食品科學學院

【摘要】雙孢蘑菇是世界第一大宗栽培食用菌,具有重要經(jīng)濟價值。為探討雙孢蘑菇子實體不同發(fā)育時期基因表達變化,利用高通量測序技術(shù)對雙孢蘑菇原基期、采收期和開傘后期等不同發(fā)育時期進行RNA‐Seq分析,共篩選到6 328個差異表達基因,其中3 941個上調(diào)基因,2 387個下調(diào)基因。Gene ontology(GO)功能聚類分析表明,差異表達基因主要富集在結(jié)合、催化分子功能組和代謝過程生物學通路中,且發(fā)育過程和有性繁殖相關(guān)的基因全部為上調(diào)表達,以利于細胞分化發(fā)育形成成熟子實體進入生殖生長階段。KEGG功能富集分析結(jié)果表明,差異基因參與了氨基酸代謝、碳水化合物代謝、核苷酸代謝、脂類代謝和能量代謝這五大代謝通路,其中差異基因主要富集在氨基酸代謝通路中,氨基酸合成相關(guān)的多數(shù)基因上調(diào)表達,表明雙孢蘑菇子實體發(fā)育形成需要一系列代謝反應協(xié)同調(diào)控,氨基酸代謝相關(guān)基因可能在雙孢蘑菇子實體發(fā)育過程中起重要作用。本文通過全面分析雙孢蘑菇子實體發(fā)育時期基因表達變化,獲得了大量轉(zhuǎn)錄本信息,為深入了解雙孢蘑菇子實體發(fā)育調(diào)控分子機理和相關(guān)功能基因提供了重要的基因數(shù)據(jù)資源。 

【基金】國家自然科學基金(31201668)； 浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重大專項(2012C12911,2016C02057‐4)~~；

【關(guān)鍵詞】雙孢蘑菇; 高通量測序; 差異表達基因; 代謝途徑分析; 氨基酸代謝;