【作者】唐利華鮑大鵬萬佳寧李燕王瑩譚琦

【機構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部應用真菌資源與利用重點開放實驗室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所

【摘要】轉(zhuǎn)錄因子在真菌環(huán)境響應及生理過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。本文利用轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)技術(shù)研究光誘導香菇菌絲轉(zhuǎn)色過程中的轉(zhuǎn)錄因子表達變化。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果表明,在光照條件下轉(zhuǎn)色的菌絲(313C)與黑暗條件下未轉(zhuǎn)色的菌絲(313W)相比,香菇菌絲中共有68個轉(zhuǎn)錄因子基因表達發(fā)生變化(48個轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)表達,20個轉(zhuǎn)錄因子下調(diào)表達);轉(zhuǎn)色的菌絲(313C)與初始未轉(zhuǎn)色的菌絲(118)相比,香菇菌絲中有80個轉(zhuǎn)錄因子基因表達發(fā)生變化(49個轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)表達,31個轉(zhuǎn)錄因子下調(diào)表達)。這些差異表達的轉(zhuǎn)錄因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族。另外,樣品的兩兩比較中差異表達的轉(zhuǎn)錄因子既存在部分重疊,也表現(xiàn)特異性。其中,313C/313W中有14個特異性差異表達轉(zhuǎn)錄因子,313C/118中有26個特異差異表達的轉(zhuǎn)錄因子。重疊的轉(zhuǎn)錄因子有64個,其中有39個表達水平上調(diào),15個表達水平下調(diào)。采用實時熒光定量PCR對幾個轉(zhuǎn)錄因子進行了表達檢測,其中部分轉(zhuǎn)錄因子的表達趨勢與轉(zhuǎn)錄組分析基本相同。這些數(shù)據(jù)為進一步研究香菇轉(zhuǎn)色的轉(zhuǎn)錄調(diào)控奠定了一定的基礎。 

【基金】上海市市級農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長計劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-9號]； 國家自然科學基金(31170098)； 上海市科委崇明專項(13391912202)~~；

【關(guān)鍵詞】香菇; 轉(zhuǎn)色; 光線; 轉(zhuǎn)錄因子; 高通量測序;