【作者】朱兆香 曾昭清 莊文穎

【機(jī)構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)食藥用菌教育部工程研究中心

【摘要】木霉屬真菌是一類重要的生物資源,在工農(nóng)業(yè)、環(huán)境保護(hù)等方面具有較高經(jīng)濟(jì)價(jià)值,對(duì)其進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的物種鑒定兼具理論意義和應(yīng)用前景。以木霉屬35個(gè)概念清晰的種為材料,選擇I TS、rpb2和tef1作為候選基因序列,利用T axon Gap對(duì)231個(gè)序列片段進(jìn)行分析,將種內(nèi)與種間序列差異以及序列獲取難易程度作為評(píng)價(jià)指標(biāo),篩選該屬的補(bǔ)充條形碼片段。結(jié)果表明,r pb2具有適宜的種內(nèi)與種間序列差異,其最小的種間差異(2.48%),大于最大種內(nèi)差異(1.8%),種內(nèi)、種間遺傳距離存在明顯的間隔區(qū),并且該基因序列具有較高的P CR擴(kuò)增與測(cè)序成功率(94.4%);I TS和t ef1基因序列的種內(nèi)與種間序列差異之間存在交叉重疊。因此建議r pb2作為木霉屬的補(bǔ)充D NA條形碼序列。  

【基金】Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31270073)； Ministry of Science and Technology of China for Fundamental Research(No.2013FY110400)；

【關(guān)鍵詞】種內(nèi)與種間序列差異; PCR擴(kuò)增與測(cè)序成功率; rpb2;