【機構(gòu)】旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點實驗室西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物保護學(xué)院

【摘要】以已公布的114種真菌線粒體基因組數(shù)據(jù)為依據(jù),對cob內(nèi)含子及其編碼的Ⅱ型LAGLIDADG歸巢內(nèi)切酶進行全面分析,以揭示其進化規(guī)律。在cob內(nèi)含子中共發(fā)現(xiàn)27個Ⅱ型LAGLIDADG歸巢內(nèi)切酶基因,其中18個位于S433內(nèi)含子插入位點,其余9個散布在另外8個插入位點。結(jié)合Pfam數(shù)據(jù),將Ⅱ型LAGLIDADG歸巢內(nèi)切酶分成10個主要類群,其中4個類群存在不同生物界物種間的水平遷移。S433位點的18個歸巢內(nèi)切酶均屬于類群1,它們與宿主內(nèi)含子可能從共同祖先垂直遺傳而來,并在傳遞過程中伴有水平遷移;其他歸巢內(nèi)切酶及宿主內(nèi)含子則應(yīng)是水平遷移的結(jié)果。類群1中的歸巢內(nèi)切酶可分為兩個亞類,兩亞類識別的靶序列存在明顯差異;保守模體氨基酸序列分析顯示它們大多數(shù)具有潛在內(nèi)切酶活性。全面呈現(xiàn)了真菌線粒體cob內(nèi)含子及其編碼的Ⅱ型LAGLIDADG歸巢內(nèi)切酶的存在狀態(tài)和進化模式,為歸巢內(nèi)切酶的改造和設(shè)計提供了新素材。 

【基金】國家行業(yè)(農(nóng)業(yè))計劃專項(No.201303016)； 西北農(nóng)林科技大學(xué)“千人計劃”引進人才項目(No.Z101021102)；

【關(guān)鍵詞】真菌線粒體; cob; 歸巢內(nèi)切酶; LAGLIDADG結(jié)構(gòu)域; 進化;