【作者】陳仁良 嚴(yán)俊杰 陶永新 謝斌 張磊 吳塔菊 李少杰 謝寶貴
【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院 中國科學(xué)院微生物研究所
摘要：真核翻譯起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通過與m RNA的5’帽子端結(jié)合,在蛋白質(zhì)的翻譯起始過程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一種富有商業(yè)價(jià)值的食用真菌,其生長發(fā)育與蛋白質(zhì)的合成代謝密切相關(guān)。本文通過鑒定草菇編碼IF4E的基因(Vv-IF4E),并根據(jù)生物信息學(xué)和實(shí)時(shí)熒光定量數(shù)據(jù)分析Vv-IF4E及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)量的變化規(guī)律。結(jié)果顯示,草菇Vv-IF4E基因上游存在較多順式作用元件,基因存在4種可變剪切體,只有一種具有翻譯起始因子的保守結(jié)構(gòu)域。預(yù)測(cè)開放閱讀框(ORF)長度為3 083bp,所編碼蛋白分子量為87.1k Da,存在35個(gè)磷酸化位點(diǎn)。Vv-IF4E蛋白結(jié)構(gòu)有異于擬南芥IF4E,但與皺木耳Auricularia delicata IF4E相似。實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果表明,Vv-IF4E與轉(zhuǎn)錄因子YRR1、ECM22存在極強(qiáng)的共表達(dá)規(guī)律。
基金：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)(2014CB138302)； 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS24)*；
關(guān)鍵詞：草菇; 蛋白質(zhì)合成; 熒光定量PCR; 共表達(dá); 皮爾森相關(guān)系數(shù);
【機(jī)構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院菌物研究中心 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院 中國科學(xué)院微生物研究所
摘要：真核翻譯起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通過與m RNA的5’帽子端結(jié)合,在蛋白質(zhì)的翻譯起始過程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一種富有商業(yè)價(jià)值的食用真菌,其生長發(fā)育與蛋白質(zhì)的合成代謝密切相關(guān)。本文通過鑒定草菇編碼IF4E的基因(Vv-IF4E),并根據(jù)生物信息學(xué)和實(shí)時(shí)熒光定量數(shù)據(jù)分析Vv-IF4E及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)量的變化規(guī)律。結(jié)果顯示,草菇Vv-IF4E基因上游存在較多順式作用元件,基因存在4種可變剪切體,只有一種具有翻譯起始因子的保守結(jié)構(gòu)域。預(yù)測(cè)開放閱讀框(ORF)長度為3 083bp,所編碼蛋白分子量為87.1k Da,存在35個(gè)磷酸化位點(diǎn)。Vv-IF4E蛋白結(jié)構(gòu)有異于擬南芥IF4E,但與皺木耳Auricularia delicata IF4E相似。實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果表明,Vv-IF4E與轉(zhuǎn)錄因子YRR1、ECM22存在極強(qiáng)的共表達(dá)規(guī)律。
基金：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)(2014CB138302)； 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS24)*；
關(guān)鍵詞：草菇; 蛋白質(zhì)合成; 熒光定量PCR; 共表達(dá); 皮爾森相關(guān)系數(shù);