【作者】楊頊 戴欣 劉力 王雪薇
【機構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點實驗室中國科學(xué)院大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院中國科學(xué)院微生物研究所微生物資源前期開發(fā)國家重點實驗室中國科學(xué)院微生物研究所網(wǎng)絡(luò)信息中心
【摘要】分別利用真菌通用引物和厭氧真菌特異引物構(gòu)建了西藏地區(qū)3種反芻動物和1種單胃動物共8份新鮮糞樣的ITS克隆文庫,以通過系統(tǒng)發(fā)育分析解析其中好氧真菌與厭氧真菌的多樣性。通用引物ITS文庫測得324條真菌序列,分別屬于子囊菌門Ascomycota 3個目、擔子菌門Basidiomycota 2個目、接合菌門Zygomycota的1個目和嚴格厭氧的新麗鞭毛菌門Neocallimastigomycota,共24個OTUs。其中,子囊菌門相對豐度最高,占80.6%;新麗鞭毛菌門相對豐度最低,僅占0.6%。大部分OTUs與已知真菌屬、種關(guān)系較遠。厭氧真菌特異引物文庫測得661條序列,全部屬于新麗鞭毛菌門,包括所有已知的厭氧霉屬Anaeromyces、盲腸菌屬Caecomyces、腸霉屬Cyllamyces、新麗鞭毛屬Neocallimastix、奧式霉屬Orpinomyces、胃梨囊霉屬Piromyces 6個屬和3個未培養(yǎng)的屬級類群(NG9、NG10、NG11),共29個OTUs。其中3個已知的單中心屬存在于所有反芻動物樣品中,并以Piromyces相對豐度最高(37.4%)。單胃動物馬糞樣中全部為NG9類群。NG9是本研究新發(fā)現(xiàn)的屬級類群,研究中同時揭示有多個未培養(yǎng)種和潛在的新種。研究結(jié)果證明青藏高原反芻動物糞棲真菌多樣性較高,并存在豐富的未培養(yǎng)種和潛在的新屬及新種。
【基金】國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(No.2011CB100800); 北京市自然科學(xué)基金項目(No.5092016);
【關(guān)鍵詞】真菌; 新麗鞭毛菌門; 反芻動物; 單胃動物; 青藏高原;