【作者】周雁 范秀芝 陳連福 邊銀丙

【機(jī)構(gòu)】華中農(nóng)業(yè)大學(xué)應(yīng)用真菌研究所

【摘要】以黑木耳和毛木耳轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的轉(zhuǎn)錄本序列為基礎(chǔ),采用軟件SSR Locator對(duì)兩個(gè)物種中SSR的數(shù)量、分布和結(jié)構(gòu)特征等方面進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)毛木耳中SSR的豐度和密度較黑木耳小。在兩者的SSR中,三堿基和六堿基重復(fù)的出現(xiàn)最多。對(duì)含量最多的三堿基重復(fù)序列的基序進(jìn)行分析表明富含GC的SSR在這兩個(gè)種的轉(zhuǎn)錄組中占優(yōu)勢(shì)地位。  

【基金】中國(guó)博士后科學(xué)基金(No.20110491164)；

【關(guān)鍵詞】黑木耳; 毛木耳; 轉(zhuǎn)錄組; 簡(jiǎn)單重復(fù)序列; 基序;