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    IGS2-RFLP、SCoT和ISSR在白靈側(cè)耳遺傳多樣性分析中的比較研究


    【發(fā)布日期】:2019-01-18  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】趙夢然 陳強(qiáng) 張金霞 鄔向麗 黃晨陽
    【機(jī)構(gòu)】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所 農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)微生物資源收集與保藏重點實驗室
    【摘要】應(yīng)用IGS2-RFLP、SCoT和ISSR標(biāo)記分析新疆5個采集地點的28個白靈側(cè)耳野生樣本的遺傳多樣性,比較這3種分子標(biāo)記在白靈側(cè)耳種質(zhì)資源遺傳多樣性研究中的效用。結(jié)果顯示,IGS2-RFLP的3個內(nèi)切酶、5個SCoT引物、5個ISSR引物分別檢測到42、59和77條多態(tài)性條帶,多態(tài)性比率分別為91.3%、92.4%和92.8%。3種標(biāo)記檢測出的有效等位基因數(shù)(ne)和位點平均的預(yù)期雜合度(Hep)沒有顯著性差異。表明3種標(biāo)記都適宜作為遺傳學(xué)標(biāo)記對白靈側(cè)耳野生種質(zhì)進(jìn)行多樣性分析。多態(tài)性檢測效率最高的標(biāo)記為ISSR,E=15.4,Ai=23.4,其次為IGS2-RFLP,E=14.0,Ai=22.4,SCoT則為最低,E=11.8,Ai=18.2。3種標(biāo)記中,SCoT和ISSR標(biāo)記的聚類結(jié)果極其相似,且均能較為準(zhǔn)確地反映樣本的地理來源,雖然二者的聚類圖不完全相同。IGS2-RFLP的標(biāo)記效率較高,準(zhǔn)確性和可重復(fù)性最好,可用于菌株標(biāo)準(zhǔn)圖譜的制作,更適用于品種權(quán)保護(hù)中的菌株鑒定鑒別;SCoT和ISSR標(biāo)記的多態(tài)性高,信息量大,評價范圍廣,則更適用于白靈側(cè)耳種質(zhì)資源的遺傳多樣性研究。 
    【基金】現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(No.CARS-24);
    【關(guān)鍵詞】野生樣本; 多態(tài)性; 有效等位基因; 預(yù)期雜合度;
     
     
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