【作者】黃晨陽 陳強(qiáng) 高山 高巍 張金霞
【機(jī)構(gòu)】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所
摘要:對(duì)側(cè)耳屬16個(gè)種的38個(gè)菌株進(jìn)行了ITS序列測(cè)定,統(tǒng)計(jì)分析種內(nèi)和種間序列趨異度。結(jié)果表明,16個(gè)種的ITS序列種內(nèi)趨異度很小,為0-0.007,其中Pleurotus djamor不同地理來源的3個(gè)菌株的趨異度為0.007。在16個(gè)種的種間ITS序列趨異度中,P.rattenburyi和P.djamor之間趨異度最大,為0.282;P.ostreatus和P.cornucopiae之間的趨異度最小,為0.003。利用ITS序列能夠?qū)?cè)耳屬的大多種類進(jìn)行有效鑒定。ITS序列差異2%-3%作為傘菌中種的鑒定臨界值在側(cè)耳屬中并不合適。而對(duì)于P.ostreatus和P.cornucopiae的準(zhǔn)確鑒定,仍需開發(fā)新的分類鑒定標(biāo)記。以香菇為外群,用貝葉斯法構(gòu)建的側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明,系統(tǒng)發(fā)育樹的部分節(jié)點(diǎn)十分可靠,后驗(yàn)概率值為0.96-1.0。
基金:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(3-27);
關(guān)鍵詞:分類鑒定; 系統(tǒng)發(fā)育; 貝葉斯法; 序列趨異度;
【機(jī)構(gòu)】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所
摘要:對(duì)側(cè)耳屬16個(gè)種的38個(gè)菌株進(jìn)行了ITS序列測(cè)定,統(tǒng)計(jì)分析種內(nèi)和種間序列趨異度。結(jié)果表明,16個(gè)種的ITS序列種內(nèi)趨異度很小,為0-0.007,其中Pleurotus djamor不同地理來源的3個(gè)菌株的趨異度為0.007。在16個(gè)種的種間ITS序列趨異度中,P.rattenburyi和P.djamor之間趨異度最大,為0.282;P.ostreatus和P.cornucopiae之間的趨異度最小,為0.003。利用ITS序列能夠?qū)?cè)耳屬的大多種類進(jìn)行有效鑒定。ITS序列差異2%-3%作為傘菌中種的鑒定臨界值在側(cè)耳屬中并不合適。而對(duì)于P.ostreatus和P.cornucopiae的準(zhǔn)確鑒定,仍需開發(fā)新的分類鑒定標(biāo)記。以香菇為外群,用貝葉斯法構(gòu)建的側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明,系統(tǒng)發(fā)育樹的部分節(jié)點(diǎn)十分可靠,后驗(yàn)概率值為0.96-1.0。
基金:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(3-27);
關(guān)鍵詞:分類鑒定; 系統(tǒng)發(fā)育; 貝葉斯法; 序列趨異度;