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    陰道分離因肯毛孢子菌的分子鑒定和種內(nèi)分型


    【發(fā)布日期】:2019-01-10  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】呂雪蓮 張曉利 王淼淼 佘曉東 呂桂霞 沈永年 劉維達(dá)
    【機(jī)構(gòu)】中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病研究所
    摘要:分別采用rRNA基因內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)和基因間隔區(qū)(IGS1)測序,ITS和IGS1區(qū)PCR限制性片段長度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)和基因組DNA的隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)等方法,對三株因肯毛孢子菌Trichosporon inkin進(jìn)行分子特征及種內(nèi)分型研究。結(jié)果顯示,不同菌株的rRNA基因ITS區(qū)和IGS1區(qū)的序列相似性均高達(dá)100%,RFLP酶切圖譜具有較理想的種內(nèi)一致性,而不同菌株的RAPD圖譜不盡相同。研究表明:rRNA基因IGS1區(qū)測序及RFLP酶切可考慮用于因肯毛孢子菌的菌種分子鑒定,而基因組DNA的RAPD則較適合于菌種的種內(nèi)分型。
    基金:科技重大專項(xiàng)(No.2008ZX10004-002); 衛(wèi)生部部屬(管)醫(yī)院臨床學(xué)科重點(diǎn)項(xiàng)目(No.2007.7); 衛(wèi)生部公益性行業(yè)科研專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)項(xiàng)目(No.200802032); 江蘇省自然科學(xué)基金(No.BK2008091);
    關(guān)鍵詞:rRNA基因測序; PCR限制性片段長度多態(tài)性分析; 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA;
     
     
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