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    基于β-微管蛋白基因部分序列探討靈芝屬菌株的親緣關系


    【發(fā)布日期】:2018-05-17  【來源】:菌物學報
    【作者】蘇春麗 唐傳紅 張勁松 潘迎捷
    【機構】南京農業(yè)大學生命科學學院微生物系上海農業(yè)科學院食用菌研究所上海水產大學食品科學學院 南京210095上海農業(yè)科學院食用菌研究所上海201106上海200090
    【摘要】PCR分別擴增了38個靈芝屬菌株的β-微管蛋白基因片段,并對PCR產物進行序列測定,得到419bp的一段核苷酸系列。根據(jù)MEGA2.1軟件中的neighbour-joiningmethods對上述序列進行聚類分析,結果所有供試菌株被分成9個聚類組。中國栽培靈芝菌株分布于6個聚類組,其中樹舌亞屬、紫芝組的菌株各自聚成一組,靈芝組的菌株分成四組,但大部分靈芝組菌株均聚于同一組,這表明樹舌亞屬、紫芝組和靈芝組間的遺傳差異較大,靈芝組內雖然存在著一定的遺傳差異,但總體上親緣關系比較近,遺傳多樣性并不豐富。同時,序列分析的結果顯示,β-tubulin基因序列在第三位密碼子和內含子部位有高的堿基替換率,這些變異提供了豐富的系統(tǒng)發(fā)育信息,提示β-tubulin基因適合于靈芝屬菌株的親緣關系研究。 
    【基金】上海市農委重點攻關項目(No.農科攻字2002-1-4-3);
    【關鍵詞】序列分析; neighbour-joiningmethods; 聚類分析; 遺傳多樣性;
     
     
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