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    基于rDNAITS序列分析Alternaria與相似屬的關系及A.leucanthemi的分類地位


    【發(fā)布日期】:2018-03-27  【來源】:菌物學報
    【作者】趙國柱 張?zhí)煊睢〔軔坌隆⊥鹾閯P
    【機構(gòu)】山東農(nóng)業(yè)大學植物病理學系 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學重點實驗室 山東農(nóng)業(yè)大學植物病理學系 山東泰安271018 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學重點實驗室 北京100080
    【摘要】對Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五個形態(tài)相似屬的代表性種進行了5.8S/ITS區(qū)段序列測定,連同從GenBank下載的相關有性型Pleospora,Lewia的同項資料,由Neighbor-joining方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。序列對比結(jié)果顯示,所有參試的菌株/種的5.8SrDNA序列保守程度較高,ITS序列變化較大,ITS1比ITS2變化更大。由5.8S/ITS構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹可以足夠?qū)⒐┰嚲鷧^(qū)分到屬;系統(tǒng)發(fā)育樹顯示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系統(tǒng)學關系較近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相對較遠的分支上,與上述四屬關系較遠,相對獨立進化;有性型的Pleospora與無性型的Stemphylium被聚到一個分支,這種不同階段菌株在遺傳基礎上的一致,充分證明所用方法及所選測序的rDNA區(qū)段對本類群真菌的分類很有價值。Alternarialeucanthemi位于系統(tǒng)發(fā)育樹的外側(cè),較為獨立進化,與Alternaria的其它種親緣關系較遠,卻與Stemphyliumspp.和Bipolarisspp.關系較近,對其目前的分類地位提出質(zhì)疑。 
    【基金】國家自然科學基金項目(39899400); 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學重點實驗室(915)課題資助;
    【關鍵詞】鏈格孢屬; 匍柄霉屬; 假格孢屬; 埃里格孢屬; 細基格孢屬; 系統(tǒng)學;
     
     
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