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    小克銀漢霉核糖體DNA PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的限制性片段長(zhǎng)度多型性(英文)


    【發(fā)布日期】:2018-01-11  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】黃河 毛偉敏 鄭儒永
    【機(jī)構(gòu)】中國科學(xué)院微生物研究所真菌地衣系統(tǒng)學(xué)開放研究實(shí)驗(yàn)室
    【摘要】應(yīng)用一對(duì)寡核苷酸引物ITS1與ITS4對(duì)核DNAG+C百分?jǐn)?shù)小于30%的小克銀漢霉(Cunninghamella)屬的核糖體DNA(rDNA)內(nèi)轉(zhuǎn)錄間區(qū)(YTS)進(jìn)行了擴(kuò)增。測(cè)試的屬于10個(gè)種和變種的22株菌都得到了擴(kuò)增產(chǎn)物。在同屬不同種之間擴(kuò)增的ITS片段長(zhǎng)度有巨大差別。據(jù)此可分為三組。這三組所含分類群數(shù)及其DNA長(zhǎng)度分別為;第一組4種1變種,小于764堿基對(duì)(bp);第二組2種,765~824bp;第三組2種1變種,大于825bp。所研究的許多種中,特別是第三組,單憑其PCR產(chǎn)物的長(zhǎng)度就能區(qū)分開來。但在第一、二組就需借助限制性內(nèi)切酶的分析才能予以區(qū)分。我們選用了RsaI,TaqI;Tru9I,和HinfI4種限制性內(nèi)切酶,對(duì)所有擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行了限制性片段長(zhǎng)度多型性(RFLPs)的分析。在雅致小克銀漢霉(Celegans)、巴西玉蕊小克銀漢霉(Cbertholletiae)、和布拉氏霉(Cblakesleeana)各種的限制性酶切圖譜,種內(nèi)非常一致而種與種之間有差別。反之,在某些種其限制性酶切圖譜不僅種間互不相同,在種內(nèi)不同株之間也出現(xiàn)1~3種酶切圖型的差異。在這種情況下,只能綜合各種資料才能將它們區(qū)分開來。本研究肯定了PCR-RFLP在區(qū)分小克銀漢霉種和變種上的意義,并發(fā)現(xiàn)種內(nèi)個(gè)體的差異。這在我們后來所進(jìn)行的序列分析研究中得到了進(jìn)一步的證實(shí)。 
    【關(guān)鍵詞】小克銀漢霉屬; 毛霉目; 分類; PCR; 限制性片段長(zhǎng)度多型性; 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間區(qū);
     
     
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