利用簡單重復序列分子標記分析我國側耳栽培菌株的遺傳多樣性(英文)
Characterization of 18 Novel Polymorphic SSR Markers and Evaluation of Genetic Diversity Within Oyster Mushroom Strains Cultivated in China
【作者】 吳丹丹； 張震； 張瑞穎； 胡丹丹； 顧金剛； 胡清秀； 左雪梅；
【Author】 WU Dandan1,2,ZHANG Zhen1,ZHANG Ruiying2,HU Dandan3,GU Jingang2,HU Qingxiu2,ZUO Xuemei21School of Life Science,Anhui Agricultural University,Hefei,Anhui 230036,China;2Key Laboratoryof Microbial Resources Collection and Preservation,Ministry of Agriculture,Institute of AgriculturalResources and Regional Planning,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China;3Beijing Academy of Science and Technology,Beijing 100089,China
【機構】 安徽農業(yè)大學生命科學學院； 農業(yè)部農業(yè)微生物資源收集與保藏重點實驗室,中國農業(yè)科學院農業(yè)資源與農業(yè)區(qū)劃研究所； 北京市科學技術研究院；
【摘要】 采用FIASCO方法,從糙皮側耳(Pleurotus ostreatus)菌株ACCC 50838分離簡單重復序列分子標記(Simple sequence repeat,SSR),所得標記用于分析我國52個側耳(平菇)栽培菌株多樣性,對于SSR標記相同的菌株再進行ISSR PCR分析。結果表明:18個SSR標記在供試菌株中的等位基因的數(shù)量為3～12個,多態(tài)性指數(shù)(PIC)為0.34～0.84;除了2組(ACCC50618,ACCC 50866和ACCC 50915;ACCC 50249和ACCC50476)共5個菌株之外,其他47個菌株都能利用這18個SSR標記進行有效的鑒別。SSR標記相同的的菌株,其ISSR、體細胞不親合性和出菇性狀(溫型、菌蓋顏色)也相同,這些菌株可能是同物異名。利用這18個SSR標記分析52個菌株的遺傳多樣性,相似性指數(shù)為0.755～0.9995。根據(jù)相似性指數(shù)進行聚類分析,52個菌株分成兩個大的類群,分別為糙皮側耳(P.ostreatus)和肺形側耳(P.pulmonarius)。結合這些栽培菌株的農藝性狀和SSR分子標記的聚類分析結果,我國平菇栽培菌株的遺傳...
【Abstract】 Oyster mushrooms represent one of the most important groups of commercially cultivated edible mushrooms worldwide.In this study,18 novel polymorphic simple sequence repeat(SSR) markers were developed and characterized from Pleurotus ostreatus,strain ACCC 50838.The number of alleles detected for each SSR locus varied between three and twelve across the 52 oyster mushroom cultivars,48 of which were previously designated as P.ostreatus and four as P.pulmonarius.The polymorphism information content(...
【關鍵詞】 簡單重復序列； 平菇類； 糙皮側耳； 肺形側耳； 遺傳多樣性； 鑒別；
【Key words】 Simple sequence repeat(SSR)； oyster mushroom； Pleurotus ostreatus； Pleurotus pulmonarius； genetic diversity； strain differentiation；
【基金】 Sponsored by the Foundation of the National Natural Science Foundation of China(No.31101588)
【分類號】S646.14