金針菇為好氣性真菌，在代謝過程中需要不斷吸收新鮮空氣。金針菇在催蕾期和子實(shí)體生長前期需要消耗大量的氧氣，特別是在大量栽培時(shí)，當(dāng)空氣中二氧化碳濃度超過0.6％，子實(shí)體和菌蓋的發(fā)育就會(huì)受到抑制。但在子實(shí)體長到4厘米高時(shí)，則需要控制菇棚內(nèi)的氧氣含量，此后若菇棚內(nèi)氧氣含量較高，金針菇菇柄短，菇帽容易開傘。
　　金針菇催蕾期和子實(shí)體生長前期要補(bǔ)氧每天將菌袋外覆蓋的薄膜揭開，并在早晨和傍晚打開棚室前后通風(fēng)口，通風(fēng)1小時(shí)，然后將菌袋外的薄膜蓋嚴(yán)保濕，關(guān)閉棚室前后的通風(fēng)口。這樣既可以補(bǔ)氧，又可以使菇棚內(nèi)保持較高的濕度，有利于催蕾和子實(shí)體發(fā)育。
　　子實(shí)體迅速發(fā)育期要控氧為保持菇房內(nèi)空氣新鮮，棚室前后通風(fēng)口可全天開放。為降低子實(shí)體周圍的氧氣含量，菌袋外覆蓋的薄膜要蓋嚴(yán)，但需在早晨和傍晚各通風(fēng)一次，排出菌袋附近的有害氣體，時(shí)間為10分鐘左右。