一、通氣不暢 草菇是高溫型好氣性真菌，生長發(fā)育過程需要足夠的氧氣。在栽培過程中為了提高堆溫，有時薄膜覆蓋時間過長，使料堆中的二氧化碳過多而導(dǎo)致缺氧，小菇因通氣不良，排氣不暢，難以正常長大而萎蔫。播種1—4天內(nèi)，要注意每天通風(fēng)半小時，隨著菌絲量的增大和針頭菇的出現(xiàn)，要適當(dāng)增大通氣量。
　　二、水分不足 草菇的生長需要大量的水分，若建堆播種時水分不足或采菇后沒有及時補(bǔ)水；草被過薄保濕性能差，均會導(dǎo)致小菇萎蔫。播種后待菌絲長滿形成針頭菇前，如水分不夠，可補(bǔ)一次重水；頭潮菇結(jié)束后要補(bǔ)足水分，晴天草被要噴水防止料內(nèi)水分蒸發(fā)。
　　三、溫度驟變 草菇菌絲生長和子實體發(fā)育對溫度有不同要求，一般結(jié)菇溫度在30℃左右。但寒潮來臨，氣溫急劇下降，或盛夏季節(jié)持續(xù)高溫會致使小菇成批死亡。因此，遇寒流要盡量采取保溫措施，盛夏酷暑要選擇陰涼場地堆料栽培，料上加蓋草被并多噴水，堆上方須搭棚遮陰。
　　四、環(huán)境偏酸 草菇菌絲適宜在偏堿性的環(huán)境中生長，當(dāng)酸堿度在PH值6以下雖可結(jié)蕾，但難長成菇。采完頭潮菇后可噴1％石灰水或5％草木灰水，以保持料堆的酸堿度在pH8左右。
　　五、水溫不適 草菇對水溫有一定的要求，如噴20℃左右的井水或噴被陽光直射達(dá)40℃以上的地面水，到第二天小菇會全部萎蔫死亡。噴水要在早晚進(jìn)行，水溫30℃左右為好。
　　六、采摘損傷 在草菇成長過程中，切忌人為碰撞、機(jī)械損傷。如采摘碰動了旁邊正在生長的幼菇，就會造成死亡。采摘草菇時動作要輕，一手按住菇的生長部位，保護(hù)好幼菇，另一手將成熟菇擰轉(zhuǎn)摘起。
　　七、菌種退化 草菇菌種無性繁殖的代數(shù)和轉(zhuǎn)管培養(yǎng)的次數(shù)過多，栽培種菌齡過大、菌種老化、生活力下降，影響?zhàn)B分的積累，第二潮菇現(xiàn)蕾后因養(yǎng)分不足而萎縮死亡。為防止這種情況發(fā)生，可用草菇幼齡菌褶分離菌種，斜面擴(kuò)大繁殖培養(yǎng)不要超過3代，栽培菌種的菌齡應(yīng)控制在1個月以內(nèi)。
　　八、感染雜菌，發(fā)生蟲害 用已霉變的稻草等原料作培養(yǎng)料，在不清潔的場地栽培，會導(dǎo)致害蟲大量發(fā)生，尤其是棉籽殼栽培草菇，螨類發(fā)生后料內(nèi)的菌絲會很快消失，使床面幼菇全部死亡。在草堆內(nèi)加3％茶籽餅粉或0.2％敵百蟲溶液，能起到防治害蟲的效果，草菇對農(nóng)藥很敏感，當(dāng)菇蕾出現(xiàn)時，切忌使用農(nóng)藥。
　　第一潮菇收獲后容易受綠霉侵染，發(fā)現(xiàn)后要及時在發(fā)生綠霉的料面撒一層生石灰粉，控制其蔓延。