食用菌的栽培周期相對較短，因此對其使用農(nóng)藥，尤其是在出菇期間使用時極易在子實體內(nèi)殘留農(nóng)藥。在國際市場上對食用菌的衛(wèi)生要求和檢測越來越嚴格，特別是我國加入ＷＴＯ后，可以預見所謂“綠色貿(mào)易壁壘”也越來越成為我國農(nóng)副產(chǎn)品特別是食用菌出口的嚴重問題。如美國等一些發(fā)達國家已明令禁止在食用菌生產(chǎn)上使用多菌靈等藥品，所以要生產(chǎn)無公害、無污染、無殘留的“綠色”食用菌，就要采取綜合措施防治害蟲。
　　
　　利用害蟲的習性進行防治
　?。?、嘖絲性
　　菌蚊的幼蟲有吐絲的習性，又群居拉網(wǎng)，一般用絲將菇蕾罩住，很容易發(fā)現(xiàn)。另外其蛹有白繭，也容易被看到，對這些害蟲可進行人工捕捉銷毀。
　　２、怕燥性
　　癭蚊有幼體繁殖的習性（一頭幼蟲可以從體內(nèi)繁殖２０多頭小幼蟲），但癭蚊蟲體小，怕干燥?？蓪l(fā)生蟲害的菌袋在陽光下暴曬１～２小時，或撒石灰，則蟲多干燥而死，可降低蟲口密度。
　?。?、喜水性
　　跳蟲有喜水的習性，對于發(fā)生跳蟲的菇塊可以用水誘集后消滅。
　?。?、變色性
　　有些鱗翅目（如谷蛾和夜蛾類）的幼蟲老熟后身體很大，顏色也較艷麗，在采菇和栽培管理中很容易被發(fā)現(xiàn)，可隨時捕捉消滅。
　?。怠②吇?
　　一些害蟲（如蠅科和螨科）對糖醋液有強烈的趨性，可在菇房中設(shè)誘殺盆，用白酒２５克，水２份，紅糖３份，醋３．５份，再加入少量敵百蟲；螨對炒熟的種子香味也有強烈的趨性，可用炒香的粕餅撒在紗布上，當螨聚集于紗布上后，把紗布在濃石灰水里浸沾，螨便被殺死，連續(xù)幾次，殺螨效果可達９０％以上。另外，用５７％辛硫磷０．２５克，麥麩１．５～２．５公斤，加適量水，傍晚撒于菇床周圍，可誘殺蟋蟀、螻蛄。
　　利用物理方法殺滅害蟲
　?。薄⒑诠鉄艋蛘诚x板誘殺
　　利用蚊蛾的趨光性可以用黑光燈或節(jié)能燈誘殺，方法是在菇房燈光下放誘盆，害蟲落入盆中即被殺死。也可以在強光處掛粘蟲板，粘蟲板上涂４０％的聚丙烯粘膠，有效期可達２個月。
　?。?、水浸法防治害蟲
　　即使蟲體浸于水中造成缺氧和促使原生質(zhì)與細胞膜分離致死。但必須注意栽培袋（塊）無污染，無雜菌菌塊，經(jīng)２～３小時浸泡不會散；否則水浸后菌塊就散掉，雖然滅了蟲，但生產(chǎn)效益也會受到損失。方法是：瓶或袋栽培的可將水注入瓶、袋內(nèi)，塊栽的可將栽培塊浸入水中壓上重物，避免浮起，浸泡２～３小時，幼蟲便會死亡漂浮，浸泡后的瓶、袋瀝干水后即放回原處。
　　３、其它方法
　　在菇房門口，窗和通氣口安裝６０目紗網(wǎng)，防止成蟲入內(nèi)；在地道菇房的進出口保持幾十米黑暗，注意隨時關(guān)燈，防止成蟲趨光而入 。
　　土農(nóng)藥防治害蟲方法
　?。?、用除蟲菊１公斤，加水２００～３００升噴霧，還有博落回，貓兒眼、青藤根，雷公藤、毛茛、石蒜等均能殺死為害段木的黑光甲。
　　２、用半夏、野大蒜、桃樹葉和柏樹葉搗爛，以１∶１加入水浸漬后取濾液噴施可殺死蚤蠅害蟲。
　?。场⒂茫埃保ヴ~藤精或１∶１５０的除蟲菊噴灑，可殺死跳蟲；另外，也可在菇床上撒一層除蟲菊或煙草粉末，也就防治跳蟲。
　　生物防治技術(shù)
　?。?、小菌蚊蛹期可被姬蜂寄生，寄生率為５０％以上，要注意保護地利用這種小菌蚊的天敵。
　?。病拇罄麃啈?yīng)用小桿線蟲寄生眼蕈蚊收到很好效果，并研究出了離體培育生產(chǎn)大量這類線蟲的方法，每年產(chǎn)量已超過２０億條線蟲。
　?。?、利用蜘蛛（如草間小黑蛛，黃褐新園蛛等）防治田間間作食用菌的菇蠅，小菇蚊等害蟲。
　　改進栽培措施
　?。薄⒏愫铆h(huán)境衛(wèi)生，清除菇房內(nèi)外垃圾，有條件的可撒些石灰保持菇房周圍干燥，特別是上一年廢料，一定要在種菇前２個月燒毀或深埋。
　　２、菌種培育室應(yīng)定期熏蒸，制作菌種時，用棉塞塞緊，外面包一層牛皮紙，可以防害蟲侵入；如菌種已發(fā)現(xiàn)害蟲，必須經(jīng)過熏蒸，或低溫冷凍等方法。
　　３、收菇后要認真清潔料面，除掉爛菇根及爛菇并集中深埋。
　?。?、對發(fā)病嚴重的老栽培室要進行熏蒸，消毒（包括種菇用過的架子、工具等）。方法是每米３容積用８０毫升福爾馬林倒入４０克高錳酸鉀中進行熏蒸，裝高錳酸鉀的容器要深，容積比福爾馬林大１０倍以上；熏蒸時要密閉栽培室，２天后打開門窗通風換氣２４小時再裝菌袋送入。也可用硫磺熏，用量為每米３ ５克，密閉４８小時后，再過２天進料。
　　５、收完３～４茬菇后，及時清除料塊，并遠離菇房高溫堆肥發(fā)酵或噴藥，避免害蟲在廢料中繁殖。
　?。?、嚴禁新老培養(yǎng)塊同放一個菇房，以免害蟲傳播到新菇塊中。
　?。?、覆土材料也要經(jīng)過高溫或藥劑處理，將害蟲殺死。
　?。?、食用菇栽培管理上要避免向菇體直接噴水及溫、濕度過高，以免造成菌絲和菇蕾腐爛，繁殖滋生害蟲。