一、菌種容器污染主要原因：
    1．裝瓶(袋)、接種及運輸過程中未輕拿輕放或機(jī)械破損所致；
    2．滅菌時溫度急驟上升或壓力急驟上升、下降、排氣速度過快，致使容器破裂造成污染。
    二、棉塞或套環(huán)污染主要原因：
    1．試管口或瓶口未洗干凈，沾有培養(yǎng)基或培養(yǎng)基與棉塞接觸；
    2．棉塞或套環(huán)被打濕；
    3．滅菌時疊放不當(dāng)，加水過多，培養(yǎng)料濕度太大。
    三、接種時發(fā)生污染主要原因：
    1．接種室、接種箱消毒不嚴(yán)，密封不好；
    2．接母種時，超凈工作臺未提前開機(jī)；
    3．接種時工具及操作人員雙手未消毒或消毒不嚴(yán)；
    4．未嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作規(guī)程。
    四、拌料污染主要原因：
    1．拌料時主料與輔料未充分拌勻；
    2．水分含量不足或培養(yǎng)料成團(tuán)未散開，吃水不透造成滅菌死角；
    3．培養(yǎng)料不新鮮，本身帶雜。
    五、母種帶雜主要原因：
    1．培養(yǎng)過程中未定期清除雜菌：
    2．轉(zhuǎn)管或擴(kuò)接母種前隨拿隨用，未仔細(xì)檢查，錯用帶雜母種。
    六、滅菌發(fā)生污染主要原因：
    1．常壓滅菌時間不夠或溫度不夠；
    2．高壓滅菌時未排盡冷空氣或排冷氣太快；
    3．裝鍋時擺放太緊密，通氣性不好，滅菌不徹底；
    4．滅菌鍋發(fā)生漏氣，溫度、壓力達(dá)不到所需數(shù)值。
    七、培養(yǎng)時發(fā)生污染主要原因：
    1．培養(yǎng)室溫度太高，雜菌易生長；
    2．培養(yǎng)室相對濕度太大，超過70％以上利于雜菌滋生；
    3．培養(yǎng)室通氣不良，有利于某些厭氧菌發(fā)生；
    4．培養(yǎng)室本身不干凈，消毒不嚴(yán)，空氣中本身帶雜；
    5．蝸類、鼠類等害蟲危害菌袋，帶人雜菌。