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    美味側(cè)耳ITS序列直接測序與克隆測序比較分析


    【發(fā)布日期】:2005-07-01  【來源】:
    【核心提示】:美味側(cè)耳ITS序列直接測序與克隆測序比較分析TheComparativeAnalysisoftheITSSequencesinPleurotussapidusObtained

    美味側(cè)耳ITS序列直接測序與克隆測序比較分析

    The Comparative Analysis of the ITS Sequences in Pleurotus sapidus Obtained by Direct and Cloned Sequencing

    鄭和斌  王作仁  呂作舟  余知和 

    摘 要:用CTAB法提取美味側(cè)耳基因組DNA,利用引物ITS1和ITS4擴(kuò)增其核糖體DNA的ITS片段,凝膠回收試劑盒純化目的片段.通過PCR產(chǎn)物雙向直接測序和克隆測序分別獲得其rDNA ITS序列,對兩種測序方法所得序列及GenBank中美味側(cè)耳ITS片段的序列進(jìn)行比較分析.結(jié)果顯示,三條序列的差異非常小,兩種測序方法所得序列僅在兩端出現(xiàn)差異,序列內(nèi)部完全一致.

    關(guān)鍵詞:美味側(cè)耳;ITS;序列測定

    分類號:S646.140.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A

    文章編號:1005-9873(2005)01-0001-04

    作者簡介:鄭和斌(1979-),男,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)應(yīng)用真菌研究所在讀碩士研究生,主要從事側(cè)耳屬真菌的系統(tǒng)分類及人工栽培研究.余知和,本文通訊作者

    作者單位:鄭和斌(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科技學(xué)院,武漢,430070;長江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,荊州,434025) 

         王作仁(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科技學(xué)院,武漢,430070) 

         呂作舟(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科技學(xué)院,武漢,430070) 

         余知和(長江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,荊州,434025) 

    參考文獻(xiàn):

    [1]凌建亞,彭俊峰.核糖體DNA ITS區(qū)應(yīng)用于蟲草屬無性型鑒定的初步研究[J].山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào) (理學(xué)版),2003,38(3):113~117.

    [2]Iwen PC,Hinrichs SH,Rupp ME.Utilization of the internal transcribed spacer regions as molecular targets to detect and identify human fungal pathogens[J].Med Mycol,2002,40:87~109.

    [3]Bunyard BA,Chaichuchote S,Nicholson MS,et al.Ribosomal DNA analysis for resolution of genotypic classes of Pleurotus[J].Mycol Res,1996,100 (2): 143~150.

    [4]Brower AVZ,DeSalle R,Vogler A.Gene trees,species trees and systematics:acladistic perspective[J].Annu.Rev Ecol Syst,1996,27: 423~450.

    [5]馬富英,羅信昌.分子標(biāo)記在食用菌遺傳育種中的應(yīng)用[J].菌物系統(tǒng),2002,21(1):147~151.

    [6]Lnnis MA,Gelfand DH,Sninsky JJ,et al.PCR protocols: A guide to methods and application[M].Academic Press,Inc.San Diego,CA,1990.315~322.

    [7]金冬雁,黎孟楓等譯,侯云德等校.分子克隆實(shí)驗(yàn)指南(第二版)[M].北京:科學(xué)出版社,1996.

    食用菌學(xué)報(bào)

    ACTA EDULIS FUNGI

    2005 Vol.12 No.1 P.1-4

     
     
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