1、保證菌種的純培養(yǎng)，注意不要用被雜菌污染的菌種，不要近距離相連接培養(yǎng)。

2、嚴(yán)格控制菌種傳代次數(shù)，減少機(jī)械損傷，保證菌種活力。

3、適當(dāng)?shù)蜏乇４婢N，低溫型菌種如蘑菇、香菇等，在4℃有利于保存菌絲體的活力，高溫型菌種如草菇在16℃有利于保存菌絲體的活力。

4、避免在單一培養(yǎng)基中多次傳代;菌種不宜過長時間使用，超齡菌種會出現(xiàn)老化，而老化與退化是有機(jī)相連的，生活力弱的菌種很容易出現(xiàn)退化。

5、菌種要定期進(jìn)行復(fù)壯，在適溫、合適酸堿度、充足氧量、無雜菌培養(yǎng)等條件下進(jìn)行。

6、每年進(jìn)行孢子分離，以有性繁殖來發(fā)現(xiàn)優(yōu)良菌株，以組織分離來鞏固優(yōu)良菌株的遺傳特性。